החיידקים הלקטובציליים הם חלק בלתי נפרד מהסביבה הטבעית של רירית הנרתיק ובין השאר הם שומרים על חומציות תקינה בנרתיק (PH). החיידקים מייצרים חומצה לקטית, ומונעים מחיידקים אחרים להידבק לנרתיק. בתנאי מעבדה, חיידקים אלו גם מסוגלים להשמיד את נגיף האיידס. מלבד החיידקים הלקטובציליים, קיימים חיידקים נוספים בסביבה הטבעית של הנרתיק: סטרפטוקוק - חיידקים גרם שליליים, גרדנרלה, חיידקים אנאירוביים, ולפעמים ניתן למצוא גם קנדידה כחלק מהסביבה הטבעית בנרתיק.